Acido nucleico bloccato, LNA

Gli acidi nucleici bloccati (LNA) sono una classe di derivati ​​nucleotidici con una struttura biciclica unica. La loro caratteristica strutturale molecolare risiede nella formazione di un sistema biciclico rigido tramite un ponte di metilene tra l'atomo di ossigeno 2'- e l'atomo di carbonio 4'- dell'anello di ribosio. Questa modifica strutturale conferisce agli LNA proprietà fisico-chimiche nettamente diverse da quelle del DNA e dell’RNA convenzionali. Dal punto di vista della dinamica molecolare, l'introduzione del ponte di metilene blocca l'anello di furanosio-ribosio, intrinsecamente altamente flessibile, in una conformazione fissa, riducendo notevolmente la libertà di rotazione intramolecolare. Questa caratteristica strutturale dà origine direttamente a tre effetti chiave:

In primo luogo, la conformazione ad anello fisso di zucchero migliora significativamente la rigidità locale dello scheletro fosfato, che conferisce agli oligonucleotidi LNA un'eccellente resistenza alle nucleasi.

In secondo luogo, il bloccaggio conformazionale consente alle basi azotate di mantenere la geometria ottimale dell'accoppiamento Watson-Crick, aumentando sostanzialmente l'affinità di ibridazione. Gli studi hanno dimostrato che una singola modifica dell'LNA può aumentare la temperatura di fusione (Tm) del duplex oligonucleotidico di 2–8 gradi e questo miglioramento della stabilità termica è particolarmente pronunciato nelle applicazioni di oligonucleotidi a catena corta.

Infine, la struttura rigida conferisce anche una maggiore specificità di sequenza alle molecole di LNA, consentendo loro di distinguere i disallineamenti di singola-base con maggiore precisione.

ad esempio i seguenti prodotti:

N. CAS:206055-79-0 LNA-A(Bz) fosforamide

N. CAS:206055-82-5 Fosforammidite LNA-5mC(Bz)

N. CAS:206055-75-6 LNA-T fosforammidito

N. CAS:206055-77-8 LNA-G(iBu)-CE-fosforamidite

N. CAS:709641-79-2 LNA-G(DMF)-fosforamidite